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第一百八十七章 胸中血未凉(7.8K)(2 / 3)

藻类等在内,总数大约有两百多万。

至于未被发现的数量就更多了,并且波动很大。

众所周知。

目前推测生物种数一共有两类方法:

一类是直接请分类学专家通过理论推算,评估世界上可能还有多少物种待发现。

另一类方法是根据已详细调查区域的物种数量,外推至全球的总物种数。

然而,这些方法有许多假设与限制,使得推算的总物种数差异甚大。

最低的推算数值是三百万,最高的甚至达到了一个亿。

目前接受度比较高的一个数字,是由夏威夷大学马诺阿分校ora教授提出来的:

870万,不包括病毒。

他是应用生物分类阶层——也就是生物课本里学过的界门纲目科属种的数量趋势,推估出出来的这个数字(/t/113/21/5970)

例如某动物门=10纲=100目=1000科=10000属=100000种,同时不同类群的分类阶层数量有相似的趋势,且高阶分类相对于种较稳定。

因此经过一系列的模拟,最终可推估得到较可信的总物种数。

ora教授的这篇论文是目前全球被引用次数最多的统计文稿之一,也算是个比较权威的推论了。

870万对比200万。

因此在青苔之中发现某种甚至多种微生物的存在,徐云真的一点儿都不惊讶。

随后他沉思片刻,对裘生道:

“老裘,先做16S相似度检测吧。”

裘生点点头,飞快的带上套...手套,说道:

“行,我立马就做。”

一般来说。

如果是培养皿培育出的菌株,检测或者对比的难度往往都不高。

但对象若是自然界富集的样本,操作起来就比较麻烦了。

徐云所说的16S相似度检测,指的是核糖体小亚基的RNA组分检测。

也就是16SrRNA。

这部分长度大约1500nt,不同物种略有差异,算是目前主流的九大新物检测步骤之一。

五分钟后。

裘生抬起头,对徐云道:

“老徐,准备好了,引物你觉得用啥?”

徐云想了想,很快道:

“1492R吧。”

“好嘞!”

半个小时后。

裘生抬起头,打了个响指:

“搞定,扩出来了,BLAST的密匙你有吧?”

徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮,随后走到操作台边,噼里啪啦的输了一大串密匙。

做过新种检测的同学应该都知道。

16S相似度检测的界限其实有些模糊,因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。

比如有的是97%,有的是99%。

只是在通常情况下。

相似度超过97%的,就可以认为是一个物种。

相似度低于97%的,就可以认为是不同物种,进行下一阶段检测。

不过就是这样一种不太精细的检测手段,却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎:

大部分样本在经过检测之后,都会发现相似度在99.99%以上,与其他某某微生物是同一物种。

总而言之。

这项技术在定属方面还是靠谱的。

又过了一会儿。

裘生一脸惊喜的抬起头,声音骤然拔高了几分:

“老徐,相似度46.9%,46.9%!!”

“毫无疑问,这是一类新物!”

徐云认真的看了他一眼,确认道:

“只有一种新物吗?”

“没错,只有一种!”

徐云若有所思的点点头,又道:

“那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”

众所周知。

新物鉴定一般都有九个流程:

1、16S相似度。

2、形态学观察。

比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等,还包括最适生长条件的确定。

3、磷脂脂肪酸鉴定,这个具有属特异性。

4、呼吸醌,也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种,这个有种特异性。

5、分子杂交,也就是测定基因组序列,草图就行,然后跟近源物种去比较。

相似度超过70%是一个种,低于70%是不同物种。

6、碳源利用情况,看一下能利用哪些碳源,一共有95种碳源的测试。

7、API试剂盒鉴定,生理生化鉴定的一方面。

8、GC含量。

9、革兰氏染色。

大概经过这些方面的检查,就可以确定是不是新种了。(注:不知道这样写的比

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